张军，深圳大学助理教授/副研究员，博导，智能科学系副主任，深圳市高层次人才，入选广东省科协青年科技人才培育计划，国际计算生物学学会中国理事会理事，中国自动化学会智能健康与生物信息专委会委员、中国计算机学会生物信息学专委会通讯委员、“新未来”青年学者研讨会执行委员。2022年于哈尔滨工业大学（深圳）取得博士学位，2023年加入深圳大学大数据国家工程实验室/人工智能学院，主要从事人工智能与生命科学交叉领域相关研究。以第一/通讯作者在Nature Biotechnology、Trends in Genetics、Bioinformatics、AAAI等国际权威期刊及会议发表学术论文20余篇，1篇入选ESI高被引论文。相关成果被国家人自然科学基金为公开报道，入选深圳大学2024年十大科技进展，荣获广东省卓越人工智能与机器人奖一等奖。兼任iMeta期刊青年编委成员，ICIC2026会议程序委员，Communication Biology、NeurIPS、AAAI、ICLR在内的多个国际期刊及会议审稿人。
面向研究生：每年招收2-3名硕士研究生，1名博士研究生，欢迎对上述方向感兴趣的同学报考。
面向本科生：同时欢迎学有余力的深圳大学本科生加入课题组开展科学研究工作。
具体要求：为人正直，勤奋踏实，有较强的编程能力以及较为独立的思考能力。
Tips：可以提前进入课题组实习，感兴趣的同学可Email联系☺。
研究课题
生物语言大模型及其在分子结构与功能分析中的应用
生成式人工智能及功能性生物分子（RNA/多肽）设计
课程教学
本科生：《人工智能导论》、《人工智能课程实训》
研究生：《生物信息学》、《研究方法与论文写作指导》
部分研究成果（*通讯作者, #共同第一作者）
1. Jun Zhang#*, Ju Zhang#, Shaoxuan Tang, Chuancheng Liu, Yushan Cai, Hao Zeng, Xiangjie Meng, Bei Liu, Yang Zhang*, Yu Wang*. Single-Round Evolution of RNA Aptamers with GRAPE-LM. Nature Biotechnology, 2026. （自然指数期刊，影响因子：41.7）
2. Jun Zhang#, Mei Lang#, Yaoqi Zhou*, Yang Zhang*. Predicting RNA Structures and Functions by Artificial Intelligence. Trends in Genetics, 2024, 40(1): 94-107. (Cell旗下子刊，影响因子：16.3)
3. Jun Zhang*, Yangyang Zhou, Tiantian Zhu, Zexuan Zhu*. PepCCD: A Contrastive Conditioned Diffusion Framework for Target-Specific Peptide Generation. Proceedings of the AAAI Conference on Artificial Intelligence, 2026, 40(33), 28256–28264. (CCF A类会议)
4. Jun Zhang*, Xueer Weng, Tiantian Zhu, Yumeng Liu, Zexuan Zhu*. Molecular-Level Protein Semantic Learning via Structure-Aware Coarse-Grained Language Modeling. Bioinformatics, 2026, 42(1), btaf654. (CCF A类期刊)
5. Yangyang Zhou#, Jiahao Li#, Simin Liu, Zifan Wang, Runhao Liu, Zexuan Zhu, Tiantian Zhu*, Jun Zhang*. PRIDA: Cross-Domain Protein-RNA Interaction Prediction based on Biological Language Models and Conditional Domain-Adversarial Learning. Bioinformatics, 2026, doi: 10.1093/bioinformatics/btag802. (CCF A类期刊)
主持的项目
国家自然科学基金-面上项目，蛋白质靶向RNA适配体计算设计与虚拟筛选方法研究，2027.01-2030.12，主持
广东省科协青年科技人才培育计划项目，人才类项目（张军），2027.01-2028.12，主持
深圳市自然科学基金-青年项目（C类），靶蛋白引导的RNA适配体设计关键技术研究，2026.05-2028.05，主持
深圳市高精尖紧缺人才启动项目，人才类项目（张军），2025.01-2027.12，主持
大数据国家工程实验室开放课题重点项目，核酸适体与靶蛋白相互作用识别方法研究，2025.01-2026.12，主持
国家自然科学基金-青年项目，基于结构语言模型的蛋白质表征及功能预测方法研究，2024.01-2026.12，主持
广东省基础与应用基础研究基金-面上项目，基于语义理解的核酸结合蛋白及其作用位点识别研究，2024.01-2026.12，主持
深圳大学青年教师启动项目，蛋白质功能预测方法关键技术研究，2024.01-2026.12，主持
个人主页：https://www.researchgate.net/profile/Jun-Zhang-222
毕业研究生
2023级：曾浩（平安科技）、翁雪儿（华为）、唐少轩（AI制药初创）
